显微镜的照明系统是用来照明被观察物的标本，根据各种显微镜的性能及使用要求的不同。其相应照明系统也有差异。照明系统一般由光源.滤色器.聚光镜.孔径光栏.视场光栏五部分组成。

按其照明光束的形式，可分为透射照明和反射照明两大类。前者适用于照明透明标本.故绝大多数生物显微镜均采用透射照明，后者适用于照明非透明物体，故在金相显微镜中广为应用。随着医疗和科研的发展需要，如高级荧光显微镜，高级型研究显微镜中也设置有透视和反射两套照明装置的。

两大类照明形式中又有临界照明和库拉照明之分。此外还有特殊用途的偏光照明.相衬照明，暗场照明，长工作距照明等；反射照明形式中有侧面照明，垂直照明等。